因此无论东林党也罢、马士英也罢，刚就任监国的福王朱由崧也罢，在这个时候也都暂时歇兵罢战，开始认真思索，这两件东西对自己的作用，或者说如何来利用这两件东西，为自己服务。
而其中又以马士英最为尴尬，因为商毅的第二份公文虽然被众人忽视，但马士英却没有，并也由此陷入两难的地步，则不论遗诏的内容，玉玺却是福王朱由崧正需要的东西。
原来马士英和江淮四镇联手，虽然迫使南京众大臣，由其是东林党接受了朱由崧，但东林党可也沒有就此善罢甘休，在朱由崧到达南京的第二天，接见群臣的时候，东林党就提出，让朱由崧先行就任监国，等形势明朗之后，再从长计议。说白了就是让朱由崧先代理着，万一崇祯皇帝哪个儿子突然跑回了南京，那就立刻下课；如果正宗皇帝的儿子不幸死绝了，咱们再立朱由崧当皇帝。而潜台词就是，否则万一正宗的皇太子来了，新皇帝又杵在那，到时候怎么收场呢？
马士英和朱由崧也没想，东林党会来这么一手，而且还是名正言顺，让人挑不出毛病来。虽然也有人闹了一通，但论耍嘴皮子，扣大帽子却是东林党的拿手好戏，三言两句就被说得哑口无言，而江淮四镇没资格参与这种朝堂讨论，也帮不上忙，因此最后马士英和朱由崧也只能接受先就任监国的结呆。
当然马士英也想尽快让朱由崧由监国变成真正的皇帝，在这个时候，如果得到大明的传国玉玺，无疑将是朱甴崧蹬基的一个大好理由。但这样一来，商毅的功劳将丝毫也不比拥立差，而为了维护商毅的形像，王维如等人就箅不是骗子，也必须成为骗子了。但这么一来，他马士英的面子往那里放呢？而且当初为了抢占浙江，马士英谁也沒说，就把王维如给派出去了，这会儿被抖出来，恐怕又给了东林党以口实，不知又遭来什么非议？
马士英在左右为难，东林党同样也犹豫不决，因为不知道遗诏的内容，谁也说不清楚，这份遗诏一但公开，对东林党来说，是好是坏。玉玺到了南京，肯定是对朱由崧和马士英有利的，但又不能这么拖着。因此史可法、钱谦益、吴甡、吕大器、姜曰广、高弘图等几个东林党的主要大臣也在一起商议了一天，但也没能议出个结果来。
最后吴甡才建议，不管怎么说，商毅的公文己经到了南京，遮是遮不住了，因此不如派一个有份量的大臣，假借迎接遗诏和玉玺、公主的名议，先到杭州去，确认是真是假，再做决定。
史可法、钱谦益等人听了之后，也都认为吴甡的建议可行，毕竟连看都没看过，就不承认遗诏和玉玺，还有崇祯的公主，恐怕说不过去。万一被马士英一党抓住了口实，自己岂不是被动了吗？因此众人又商议了一阵，决定就派吴甡去杭州，一来吴甡是北京朝廷的内阁大学士、督师，这份量是足够的，而且商毅还算是吴甡的部下，过去两人的关糸看上去也不错，由吴甡去杭州，许多上不了台面的话也好说一些。
吴甡当然也知道自己是推不掉这一趟的，因此也没有做推辞，立刻点头答应下来。
第二天勤见朱由崧时，史可法立刻提出，应该派人去杭州迎请崇祯的遗诏和玉玺、公主，并推荐吴甡前往。马士英也是聪明人，一下就明白了东林党的算盘，虽然他没有理由阻止，但也建议朱由崧，派卢九德随行，一起前往杭州。朱由崧虽然不懂这里面的套套，但对他是言听计从，因此也依言诏准。
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